我们继续招聘生物信息学博士后

中国科学院昆明植物研究所植物多样性与基因组学大研究团队是由李德铢研究员领衔的大研究团队,主要开展植物多样性与系统发育基因组学、比较和功能基因组学、iFlora研制与野生种质资源保藏和利用研究,围绕研究所三个重大突破中的“引领iFlora研究计划”和“植物种质资源与产业发展”开展相关研究工作,并提供iFlora综合服务。iFlora生物信息研究团队是大研究团队的重要组成部分,团队负责人寸玉鹏正高级工程师为2018年引进的海外杰出人才,主要从事以机器学习为主的生物信息算法研究,同时开展植物多样性与系统发育基因组学、比较和功能基因组学研究。寸玉鹏博士的个人网页: https://cunlab.org。 

  寸玉鹏博士,师从德国人工智能先驱波恩大学的Armin B. Cremers教授和Holger Froehich教授,进行机器学习和生物信息学算法研究,并于2014年3月获得博士学位;2013年9月进入德国科隆大学医学院转化基因组学系,在Martin Peifer教授和Roman Thomas教授的指导下进行计算生物学的研究。以第一作者和通讯作者在Nature Protocols, Bioinformatics, BMC Bioinformatics,PLoS ONE 等杂志发表生物信息学算法文章5篇,并作为主要成员贡献了Nature, Nature Communications等多篇论文的数据分析。寸玉鹏博士现为Bioinformatics,Briefings in Bioinformatics,BMC Bioinformatics等杂志的审稿人。 

  因团队发展需要,现公开招聘数名从事生物信息学的博士后研究人员1-2名,具体事宜如下: 

  一、应聘条件、职责和待遇 

  (一)应聘条件 

  1. 具有信息学、统计学、生物信息学或相关学科博士学位(暂未拿到博士学位证书者可先提供同意授予学位证明),并具备C/C++, R, Python等编程基础和统计学/机器学习数据分析经验,在国际期刊上以第一作者发表过研究论文,或在重要的学术论文上有突出的数据分析贡献。 

  2. 热爱科研、对工作认真负责、勤奋努力。 

  3. 有良好的团队合作精神和中英文写作能力。 

  4. 年龄一般不超过35周岁。 

  (二)工作职责 

  1. 主要从事植物基因组、图片的物种鉴定和分类算法研究的新方法和新策略。 

  2. 协助课题组长进行研究生和高性能计算资源的管理。 

  3. 独立和协助申请、承担相关的研究课题。 

  (三)相关待遇及管理 

  1. 住房:研究所为博士后人员提供博士后公寓。   

  2. 薪酬:每月7000元-15000元左右(由基本工资、岗位津贴、基础性绩效津贴三部分构成),年底根据工作具体情况还可享受奖励性绩效津贴。按照相关规定享受社会保险和住房公积金。    

  3. 住房补贴:600元/月。 

  4. 日常管理:按照博管会和研究所相关规定执行。    

  5. 博士后出站成绩优异者可直接申报研究所副研究员岗位,或推荐至国外知名实验室深造。 二、招聘程序 

  (一)资格审查:申请人提交如下申请材料: 

  (1)个人中文简历 

  (2)2位本领域同行专家推荐信(其中一位为博士导师) 

  (3)主要成果(代表性论文、专著、专利等) 

  (4)学历、学位证书复印件 

  (5)身份证或护照复印件 

  (6)认为有必要提供的其他材料 

  由研究所管理部门对申请人进行资格审查。 

  (二)网上申报:通过审查后申请人登录中国博士后网站http://www.chinapostdoctor.org.cn进行网上申报。具体申请流程按照网站“办事指南”要求操作,并提交相关进站纸质材料。研究所管理部门网上审核后提交博管会审批。 

  (四)博管会审批:博管会对研究所上报的招聘候选人选进行审批,审批通过的下发同意招收批件。 

  (五)进站:研究所根据博管会进站批件通知申请人进站,并签订工作协议。 

  三、招聘截止时间:本招聘启事有效期至录用到合适的人员为止。 

  四、联系方式 

  请将应聘材料发至以下邮箱,标题请注明“应聘-寸玉鹏研究组-姓名”。材料不全者将不予考虑,未通过资格审查者恕不另行通知。 

  1. 需了解项目组研究情况,请与寸玉鹏老师联系。电子邮箱:cunyupeng@mail.kib.ac.cn  

2. 研究所管理部门组织人事处:联系人:殷文;电话:0871-65223006-801;传真:0871-65223169 ;电子邮箱:yinwen@mail.kib.ac.cn;地址:云南省昆明市盘龙区蓝黑路132号组织人事处;邮编:650201。

日本国立遗传所的Saitou教授来访

11月1号,我们有幸邀请到日本三岛国立遗传学研究所群体遗传学部的Saitou Naruya教授给我们昆明植物所做一个系统发育树构建方法的讲座题为:Characteristics of molecular phylogenies and methods to construct phylogenetic trees。顺便还请到了德州大学的符云新教授,Saitou教授的助手Jinan博士和云南大学的柳树群教授、于黎教授参与了讲座和讲座后的讨论。

Saitou教授是在分子演化领域做了许多重要贡献,其代表作是系统发育树里的NJ法(从1987发表到现在已被引用了5万次以上)。这次讲座他将给介绍系统发育树构建方法的简史,并介绍其最新发展的基于全基因数据上万个位点进行快速构树的“swift NJ”法。Saitou教授的这个方法是对基因组时代的大规模数据构建系统发育树大胆尝试。

Saitou教授的讲座得到在昆明师生的热烈欢迎!

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欢迎葛林梅加入我们的团队

葛林梅硕士毕业于浙江大学,2018年10月中旬加入我们团队从事生物信息和植物基因组学的研究!葛林梅硕士期间以第一作者发表SCI文章1篇,核心期刊1篇,其中《双生病毒(Geminiviruses)的种群遗传结构和进化》研究结果以第一作者发表Journal of Virology (IF2007=5.332),该文现已被他引100多次并被权威期刊Nature Reviews Genetics作为重要结果介绍。

我们团队继续招聘博士后、研究助理,客座研究生和本科实习生,欢迎对计算生物学和生物信息学感兴趣的同仁来信咨询。

欢迎时有财加入我们的团队

时有财硕士毕业于中科院昆明植物所,于2018年9月底以研究助理的身份加入我们团队从事生物信息和植物系统学的研究!

我们团队继续招聘博士后、研究助理,客座研究生和本科实习生,欢迎对计算生物学和生物信息学感兴趣的同仁来信咨询。

 

iFlora生物信息学中心开始招人了

我们“iFlora生物信息学中心”隶属中国科学院昆明植物研究所西南野生生物种质资源库,由寸玉鹏研究员领衔组建。我们主要从事机器学习为主的生物信息算法研究,开展植物多样性与系统发育基因组学、比较和功能基因组学的研究。欢迎生物信息学、数量/理论群体遗传学、信息学类、统计/数学专业的博士、硕士申请!

我们对专业能力及要求:
1. 至少熟练拥有一种或多种语言的编程能力:R, Python, C/C++;具有较强的统计学建模基础或算法的软件实现经验;
2.已取得以下专业硕士/博士学位的申请者优先:生物信息学/图论/机器学习/统计学;
3. 语言能力:具有良好的中英文的写作和语言交流能力;
4. 对科学有强烈的兴趣、并具备良好的合作精神和对工作孜孜以求的旺盛精力。

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中性理论五十年

今年是中性理论提出的五十周年,翻到以前的写的一篇小文纪念一下。

中性突变——随机漂变假说 
木村资生的分子演化理论的“中性突变——随机漂变假说”即“中性演化学说”,简单地可以比喻为:很大的一群人去买彩票,假设没有内幕操作,这个群体中每一个中奖的概率应该是一样(和你的肤色、学理、财富无关,也就是没有选择偏好)。在理论群体学的文章中,你会常常看到这样的描述:

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我在中科院昆明植物开始新的研究

在经历了短暂的公司研发后, 从2018年7月起, 我又回到学术圈在中国科学院昆明植物所做PI,领导一个生物信息学研究的实验室,从事二代、三代基因组数据的从头组装、遗传变异分析和相关的比较基因组学研究。 研究方向主要侧重于应用统计/概率论理论,机器学习(统计学习)算法到最新的计算生物学问题中,特别关注的数据是植物基因组。

欢迎有兴趣的同仁加盟我们实验室。实验室现有助理研究员、博士后、研究生和客座研究生等职位开放,欢迎有计算机、数学、物理或具有生物信息应用技术背景的人应聘。

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